Багато в чому така оцінка головного героя — заслуга самого автора. И.С. Тургенев сам не визначився у відношенні до Базарову. З одного боку, він виправдовує і оцінює Базарова належним чином, цілком щиро захоплюючись його розумом, твердістю, умінням відстоювати свої ідеали і домагатися бажаного; наділяє цей образ рисами, яких не має сам. Але, з іншого боку, читач відчуває (прямо
вказівки на це немає в тексті, але це прослизає само собою, окрім волі автора), що Базарів чужий авторові, незрозумілий — Тургенев щиро хоче змусити себе полюбити свого героя, «спалахнути» його ідеєю, але безрезультатно. Автор і його головний герой так і залишаються по різні сторони.
Саме це і наштовхує на думку про жахливу самотність Базарова. Він титаничен, незвичайно сильний, але в той же час нескінченно нещасний і самотній. Ймовірно, це доля будь-якої видатної людини. Та і сам Базарів не прагне до того, щоб сподобатися людям, швидше навпаки. По його власному зауваженню, «справжня людина та, про яку думати нічого, а якого потрібно слухатися або ненавидіти». Його однодумці, визнаючи Базарова сильною особою, здатні лише на поклоніння і пародіювання, не претендуючи на більше. А це Базарів якраз і зневажає в людях. Він постійно шукає людини, рівної собі по силі, і не знаходить його. Єдино, хто наважується протистояти цьому бурхливому натиску, це Павло Петрович Кирсанов, але зовсім не тому, що він такий же титан, а тому, що його принципи, на відміну від базаровских, які «висять в повітрі» і живляться виключно енергією їх автора, вростають у віки. Ці духовні цінності, історичні корені, устрій Павло Петрович сприйняв ще в дитинстві. У своїх спорах з Базаровым П. П. Кирсанов відстоює своє минуле, своє життя, яке він не мислить іншій, і це надає йому сил в сутичці з титаном, який може протиставити в цій сутичці тільки себе, своєї могутньої особи. Але, незважаючи на очевидність того, що Базарів не прав, його безкомпромісна боротьба викликає захоплення.
Автор як би увесь час нагадує читачеві, що Базарів не чудовисько, не злий геній, а передусім нещасна людина, самотня і, незважаючи на усю силу розуму і енергію, беззахисна перед найпростішими людськими почуттями. У стосунках з Одинцовой проявляється його уразливість. Підсвідомо Базарів шукає любові, але справжня, висока любов йому недоступна, тому що він бездуховний і безнравствен. Одинцова ж чекає від нього зрілих почуттів, їй потрібна серйозна любов, а не швидкоплинна пристрасть. У її житті немає місця потрясінням, без яких себе не мислить Базарів. Він не розуміє, що неодмінною умовою досягнення духовних і моральних ідеалів є стабільність. А ці ідеали для нього недоступні (хоча він і мучиться від їх відсутності, не віддаючи собі в цьому звіту), оскільки, будучи прагматиком, він повинен усе промацати, поторкати.
І тут виходить якийсь замкнутий круг. Базарів кидається в цьому крузі самотній, такий, що зневірився. Він суперечливий до абсурду. Базарів заперечує романтизм, але за своєю суттю є романтиком, він зрікається від батьків, від «безглуздого життя батьків», але сам, в пориві одкровення, признається Аркадію у своїй любові до них, він робить усе, на його думку, для благополуччя батьківщини, але сам задається питанням: чи «Потрібний я Росії? Ні, видно, не потрібний». Страшно почувати себе в такому замкнутому крузі протиріч, і це важко навіть такої сильної і не* залежної особи, як Базарів. Як жахливо, помираючи, усвідомлювати даремність, безглуздя, непотрібність прожитого життя. Адже виправити вже нічого не можна. А Базарів, на мій погляд, досить розумний, щоб, нехай на смертному одрі, усвідомити свої помилки. Він визнає своє безсилля перед смертю, значить, не усе можна здолати за допомогою сили. Базарів повертається до природи, яку за життя він сприймав так матеріалістично («Я помру, і з мене лопух рости буде», «Природа не храм, а майстерня, і людина в ній працівник»). Перед лицем природи, перед лицем всесвіту навіть такий титан, як Базарів, здається жалюгідною піщинкою. У цьому і є його трагічна самотність, він не відчуває себе частиною цього світу, навіть після смерті залізна огорожа, що оточує його могилу, відділяє його від світу. Після смерті він залишається як і раніше самотній.